稽查局和税务局是属于从属的关系。稽查局和税务局的区别在于职责不同、机构属性不同、机关隶属不同、内设机构不同。主要职责不同：稽查局主要负责起草税务稽查法律法规草案、部门规章及规范性文件；办理重大税收案件的立案和调查的有关事项并提出处理意见；指导、协调税务系统的稽查工作，税务局具体承担所辖区域内各项税收、非税收入征管等职责。
机构属性不同：稽查局是国家税务总局主管税务稽查工作的职能部门，税务局是属于正部级的国务院直属机构。
机关隶属不同：稽查局是国家税务总局的职能部门，而税务局隶属于中华人民共和国国务院。
内设机构不同：稽查局内设机构有：综合处、制度处、系统工作处、举报中心、稽查一处、稽查二处、稽查三处、稽查四处、稽查五处；税务局内设机构有：办公厅、政策法规司、货物和劳务税司、所得税司、财产和行为税司、国际税务司、收入规划核算司、纳税服务司、征管和科技发展司、大企业税收管理司、稽查局、财务管理司、督察内审司、人事司、机关党委、离退休干部办公室、巡视工作办公室。
