工程预付款起扣点计算公式是T＝P－M/N，T表示的是起扣点，即预付备料款开始扣回的累计完成工作量金额；M表示的是预付备料款数额；N表示的是主要材料，构件所占比重；P表示的是承包工程价款总额或建安工作量价值。起扣点的公式表达的意思是未完施工工程所需主要材料和构件的费用等于工程预付款的数额。
预付款的概念是施工企业承包工程，一般实行包工包料，需要有一定数量的备料周转金，由建设单位在开工前拨给施工企业一定数额的预付备料款，构成施工企业为该承包工程储备和准备主要材料、结构件所需的流动资金。
起扣点是在合同中规定的，可以是整个工程量的10%的时候也可以是工程量的40%的时候，这主要是在合同中的，退回来那是因为，这一部分的预付款是业主给施工买材料用的，并且只可以买材料。
在承包人完成累计金额达到合同总价一定比例后，采用等比率或等额扣款的方式分期抵扣。也可针对工程实际情况具体处理，如有些工程工期较短、造价较低，就无需分期扣还；有些工期较长，如跨年度工程，其预付款的占用时间很长，根据需要可以少扣或不扣。
