虹吸式马桶原理是根据虹吸现象，借助冲洗水在马桶中的排污管道内充满水后构成的能快速的将污物排走。在虹吸式马桶的池壁中存水的面积比较大，因此防臭的效果比直冲式的马桶好。市场上的座便器的冲水原理基本是直冲式和虹吸式两种大类。
虹吸式中又分旋涡式虹吸和喷射式虹吸。虹吸式马桶内有一个完整的管道，形状呈侧倒状的"S"，池壁坡度较缓，噪音问题有所改善；具有排污能力强，选净面大的特点，所以绝大多数马桶尤其是连体均采用虹吸式。
虹吸式马桶优点就是冲水噪音小，也就是所谓的静音，容易冲掉黏附在马桶表面的脏物。虹吸式马桶缺点是：池底存水面积增大。
坐便器返味一般来源于两个方面，一是下水道的返味，对于阻断下水道的臭味，一般较正规厂家的产品基本能达到要求，用水密封气体还是比较有保障的，如果真是下水道的返味，那大多不是坐便器本身的问题，应该是安装上的问题。如果水封不合格，深度不够，就会降低坐便器的防臭能力，水道中的污物发酵产生的废气会通过不合格的水封溢出返味。一般直冲式坐便器水封小，防臭、防粘功能不如虹吸的。
